Фото: із відкритих джерел
Компанія Agdia, Inc. повідомила про комерційний запуск польового швидкого молекулярного тесту для виявлення Cucumber vein yellowing virus (CVYV) на платформі AmplifyRP® XRT. Також доступне лабораторне тестування зразків у діагностичній службі компанії з розширеним скринінгом патогенів гарбузових, що включає CVYV.
Про це повідомляє сайт Аграрії разом з посиланням на сайт Global Agriculture.
Agdia, Inc. оголосила про комерційний запуск польового швидкого молекулярного тест-набору для виявлення вірусу пожовтіння жилок огірка (Cucumber vein yellowing virus, CVYV). Рішення працює на платформі AmplifyRP® XRT і призначене для діагностики безпосередньо на місці відбору зразків.
Окрім польового тесту, виробники можуть надсилати зразки до діагностичної лабораторії Agdia Testing Services для розширеного скринінгу патогенів гарбузових культур, який тепер включає й тестування на CVYV.
Що відомо про CVYV і чому важлива точна діагностика
CVYV — фітопатогенний вірус роду Ipomovirus, який переважно уражує гарбузові культури, але може інфікувати й інші рослини, зокрема деякі бур’яни, що можуть слугувати природними резервуарами інфекції. За даними з публікації, вірус найчастіше фіксували в Середземноморському регіоні; серед країн, де повідомляли про виявлення, названі Кіпр, Іран, Ізраїль, Йорданія, Португалія, Іспанія та Туреччина.
Передавання CVYV пов’язують із білокрилкою Bemisia tabaci (silverleaf whitefly), а також із механічним перенесенням, зокрема під час обрізування.
Серед культур, які мають найбільше економічне значення в контексті CVYV, у матеріалі зазначені огірок (особливо партенокарпічні огірки), диня, гарбуз і кавун.
Симптоми, які можуть маскуватися під інші проблеми
Прояви хвороби залежать від виду рослини-господаря, однак загалом можуть включати:
- хлороз;
- просвітлення жилок (vein clearing);
- пригнічення росту (stunting);
- некроз;
- розтріскування або розколювання плодів.
У публікації підкреслюється, що частина цих симптомів може бути схожою на прояви інших вірусів або дефіцитів елементів живлення, тому коректна діагностика є критичною для вибору заходів захисту.
Технічні характеристики та параметри
- Платформа: AmplifyRP® XRT.
- Призначення: onsite (польове) виявлення CVYV.
- Діагностична специфічність: 100% (58 із 58 істинно негативних зразків визначено як негативні); під час валідації не зафіксовано перехресної реактивності з іншими протестованими патогенами.
- Діагностична чутливість: 98,3% (виявлено 119 із 121 позитивного зразка).
- Охоплення ізолятів: тест виявляє (або, за прогнозом in silico, має виявляти) всі відомі ізоляти з різних географічних регіонів; у матеріалі наведені приклади: Ізраїль, Ліван, Іспанія, Португалія, Йорданія, Оман і Судан.
- Сумісне обладнання (згадане в матеріалі): портативний ізотермічний флуорометр AmpliFire® Pro (позначено як «coming soon»).
Що це може означати для виробників гарбузових
Польовий молекулярний тест може бути корисним у ситуаціях, коли потрібно швидко відрізнити вірусну інфекцію від схожих за симптомами проблем (інші віруси або дефіцити живлення) та оперативно ухвалювати рішення щодо подальших дій у посівах або теплицях. Для ширшої діагностики, за інформацією з матеріалу, доступне надсилання зразків у лабораторію Agdia Testing Services для розширеного скринінгу патогенів гарбузових, включно з CVYV.