Фото: із відкритих джерел
Дослідники Чжецзянського університету представили польовий метод швидкої візуальної діагностики Tomato leaf curl New Delhi virus (ToLCNDV), поєднавши RAA-ампліфікацію та систему CRISPR-Cas12a. За даними авторів, тест показав високу специфічність і чутливість до 10^1 копій/мкл та узгоджувався з результатами ПЛР.
Про це повідомляє сайт Аграрії разом з посиланням на Hortidaily.
Фахівці Чжецзянського університету розробили новий метод швидкого візуального виявлення Tomato leaf curl New Delhi virus (ToLCNDV) — збудника, який спричиняє значні втрати врожаю у світі. Рішення орієнтоване на ранню діагностику безпосередньо в полі та має допомогти стримувати поширення вірусу в важливих культурах, зокрема серед представників родин пасльонових і гарбузових.
Як працює метод
Метод поєднує рекомбіназно-асистовану ампліфікацію (recombinase-aided amplification, RAA) із системою CRISPR-Cas12a. У матеріалі зазначається, що така комбінація має забезпечити швидку, надійну та відносно недорогу діагностику ToLCNDV у польових умовах.
Результати випробувань, наведені у дослідженні
За даними авторів, система продемонструвала високу специфічність: під час тестування не було зафіксовано перехресної реакції з близькоспорідненими рослинними вірусами. Межа виявлення вірусу, як повідомляється, сягала 101 копій/мкл.
Оцінка 28 зразків показала результати, узгоджені з традиційною полімеразною ланцюговою реакцією (ПЛР). Додатково 12 польових зразків протестували у форматі «one-pot» RAA-CRISPR-Cas12a у поєднанні зі спрощеним (crude) методом екстракції ДНК — і результати також відповідали попереднім, що, на думку дослідників, підтверджує придатність підходу для використання на місці відбору проб.
Що це може означати для виробництва
Якщо заявлені характеристики підтвердяться в ширшій практиці, такий «one-pot» візуальний тест може бути корисним для оперативного скринінгу посадок томата та інших чутливих культур у господарствах і розсадниках, коли важливо швидко відрізнити вірусне ураження від інших причин пригнічення рослин і своєчасно ухвалити рішення щодо подальших дій у вогнищі.